隨著任天堂Switch 2將自6月5日起在全球陸續上市，雖然理論上Switch 2與Switch主機具有相當高程度的相容性，不過仍不免出現如硬體特性、系統等產生的未完全相容情況；任天堂在2025年5月27日自主揭露一份相容性報告，列出現階段確定完全無法相容、執行時會出現明顯問題以及偶發問題等情況的遊戲，不過由於第三方內容高達15,000款，目前仍有約30%左右的遊戲內容仍在驗證中；然而任天堂本身推出的內容僅有一款無法相容，而且問題並非出在遊戲內容。
根據任天堂公布的相容性比例列表，任天堂推出的Switch內容基本上都能通過與Switch 2的相容，唯獨搭配紙板套件的Nintendo Labo Toy-Con 04: VR套裝由於Switch 2尺寸變大的原因造成無法相容；另外目前多數完全無法相容的內容都是屬於串流內容，然而理論上開發商願意應該會重新提供新版App，不過問題仍出在Switch 2用戶使用這些串流服務的比重到底多高。
另外目前有包括129款第三方開發商的Switch內容在Switch 2確認有明顯的問題，此外有49款內容確認基本上可正常執行但有部分情況，還有49款內容則是有相容性政策的問題，任天堂當前正在與開發商尋求解決方式；另外有部分任天堂本家遊戲需要搭配Switch的JoyCon才能遊玩，不過提到玩家需要自行解決幫JoyCon充電的問題。
