NVIDIA開放更多運算資源協助抗疫 希望藉由GPU加速病毒研究

2020.03.21 05:43PM
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照片中包含了阿利坎特總醫院冠狀病毒醫院、冠狀病毒、醫院、健康、冠狀病毒病2019

NVIDIA免費開放的Parabricks軟體,是以著名基因組分析工具包 (Genome Analysis Toolkit)為基礎,藉由GPU加速方式讓分析基因組定序資料速度提升50倍。藉由GPU加速將可讓單一伺服器上分析人類全基因組變異點偵測所需時間,從原本數日降低至不到一小時即可完成。

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除了日前呼籲使用旗下GPU產品的人,可以透過網路連線方式貢獻額外GPU算力,藉由分散運算資源整合效果,加快Folding@home分析新型冠狀病毒研究效率,NVIDIA稍早宣布向研究人員免費開放使用Parabricks軟體,藉由GPU加速執行基因組定序軟體,進而能加速新形冠狀病毒研究分析。

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因應新形冠狀病毒疫情在全球擴大,NVIDIA宣布開放多項研究工具提供研究人員使用,其中包含針對研究人員提供免費90天的Parabricks軟體使用權,讓全球對抗新形冠狀病毒的研究人員使用。

Parabricks軟體是以著名基因組分析工具包 (Genome Analysis Toolkit)為基礎,藉由GPU加速方式讓分析基因組定序資料速度提升50倍。藉由GPU加速將可讓單一伺服器上分析人類全基因組變異點偵測所需時間,從原本數日降低至不到一小時即可完成。

而使用Oxford Nanopore長片段定序資料的研究人員,目前已經可在GitHub找到GPU加速資料庫,包含Medaka、Racon、Raven、Reticulatus,以及Unicycler等應用程式現在也能採用NVIDIA GPU加速技術提昇運算效率。

NVIDIA表示,在目前疫情嚴峻情況下,將盡全力協助全球研究人員,並且透過GPU加速資源縮短病毒研究所需時間。目前NVIDIA也與雲端服務供應商、超算中心商討,希望能進一步提供藉由雲端存取的NVIDIA GPU運算資源,以及Parabricks軟體相關資源。

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