由 NVIDIA 投資的英國最強超算系統 Cambridge-1 正式上線,將促進英國數位生物學與生命科學發展

2021.07.07 12:42PM
照片中提到了NVIDIA,跟英偉達有關,包含了超級電腦、電腦、Radeon

在去年 NVIDIA 宣布收購 Arm 計畫時,除了強調不會更動 Arm 的組織架構並保有 Arm 英國技術之光的使命外,另還有一項重大宣布即是斥資 1 億美金 Arm 總部所在的英國一套全新的 AI 超算系統 Cambridge-1 ,性能亦為全球當前前 50 大超算系統,這款系統也在近日正式宣布上線,藉由 AI 與算力將作為英國數位生物學、基因組學、量子運算與 AI 等技術發展的根基,提供英國醫療照護研究應用開發。

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▲ Cambridge-1 由 DGX SupePOD 架構組成

Cambridge-1 / 劍橋一號的第一號專案,是 NVIDIA 與包括阿斯特捷利康、葛蘭素史克、蓋伊和聖湯瑪斯國民保健信託基金會、倫敦國王學院、 Oxford Nanopore 等共同推動的醫療領域合作,針對失智症等腦部疾病進行解析並結合 AI 開發藥物,同時提升尋找引發疾病的人類基因變異的精確度。

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▲ Cambridge-1 以 80 套 DGX A100 系統構成

Cambridge-1 由 NVIDIA SuperPod 超級運算叢集架構組成,以 80 套結合 NVIDIA A100 GPU 、 BlueField-2 DPU 、 NVIDIA InfiniBand 網路技術構成的 DGX A100 系統構成(補充: CPU 則是 AMD EPYC ),可達到超過 40PFLOPS 的 AI 算力與 8PFLOPS 的 Linpack 效能,同時輔以 NVIDIA Clara 與 AI 框架,為英國提供包括加速運算、 AI 、生命科學領域等技術,並藉由 100% 再生能源運作。當前預估 Cambridge-1 可在未來 10 年為英國創作出 6 億英鎊的估值。

在 5 家 Cambridge-1 先行導入應用的創始夥伴中,阿斯特捷利康/ AstraZeneca 將藉由 AI 技術加速藥物開發革新,透過 MegaMolBART 藥物開發模型用於反應預測、分子優化與分子重新組成,同時也將進行另一個專注於數位病理學 AI 的專案,透過大量使用切片影像訓練的非監督式 AI 演算法免除病理切片影像標註,並找出與藥物反應相關的潛在影像特徵。

葛蘭素史克/ GSK 則專注在進行基因驗證,使藥品的可用性提升兩倍, GSK 透過人體遺傳學、功能基因組學與機器學習技術為健康進行預測,同時開發出臨床成功率高出一倍的優質藥物。

倫敦國王學院則是攜手蓋伊和聖湯瑪斯國民保健信託基金會應用 AI 進行腦部合成資料,透過學習各年齡與病狀的數萬張 MRI 腦部掃描影像,教導 AI 建構出合成的立體腦部影像與藉由選定的特徵輸出無數張腦部影像,藉此使腦部影像的資訊得以透過 3D 方式呈現,有助於理解失智症、中風、腦癌、多發性硬化症等疾病,並促使早期資料。

Oxford Nanopore 則專注於可擴充且即時的基因組學應用,藉由在各基因組定序平台導入 NVIDIA 技術,開發能提升基因組分析速度與精準度的 AI 工具,當 Oxford Nanopore 能取得 Cambridge-1 的資源,能夠大幅縮減執行與改善演算法關鍵任務的時間,將原本須以數日才能完成的作業縮減至數小時。

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