Folding@Home 是已經推出數年、藉由號召電腦使用者在閒暇時分享電腦運算力為科學分析貢獻一己之力的一項分散式運算計畫,而受到自去年底爆發的武漢肺炎 COVID-19 引響,使原本在今年初僅有三萬台電腦加入計畫的 Folding@Home 在自 3 月 15 日號召大家一同對抗武漢肺炎後,在短短十天內有超過百萬部電腦加入計畫,當中有超過 35.6 萬張 NVIDIA GPU 的算力挹注,而今運算力亦突破 1.5 exaflops ,亦超越當年最強地球前 50 強超級電腦的總算力,並先行美國能源局預計在 2021 年才推出的新超級電腦一步達到 exaflops 性能。
▲藉由分散運算模擬武漢肺炎病毒蛋白感擾健康細胞的動畫
對抗引發全球性災難的武漢肺炎,研究人員需要更龐大的運算力,而在 Folding@Home 達到 exaflops 算力前,研究人員就已經發表一部武漢肺炎所屬的冠狀病毒蛋白是如何感染健康細胞的動畫,此項研究成果以 Folding@Home 針對伊波拉病毒進行的實驗作為基礎,以過去廣泛研究包括病毒在內之組成生物基礎的蛋白質是如何摺疊成 3D 立體狀執行各種功能,而透過基於這項模擬的分析,有可能從中挖掘出對抗武漢肺炎的藥物或疫苗的分子標靶,而分析武漢肺炎的蛋白質結構也需要族以模擬園子等級的交互作用,並產生科學視覺化的圖形。
Folding@Home 除繼續鼓勵電腦使用者能把電腦閒暇時的運算力貢獻給這套分散系統外,同時也在開放性一般研究網站與生物學等專業領域公開實驗相關資料,此外更宣布一批小分子篩選模擬作業,能優先區分 COVID Moonshot 進行合成與化驗的分子。
Folding@Home 下載: Folding@Home
開放性一般研究網站: OSF Home
生物學等專業領域: CSH Lab
同時美國能源局也針對武漢肺炎成立 COVID-19 高效能運算聯盟,以 16 台超級電腦、 3.6 萬張以上的 NVIDIA GPU 達到 330 petaflops 的總運算效能,並且開發人員亦於 #buildforCOVID19 黑客松活動撰寫多個專案程式碼,預計在 4 月 10 公開成果。
COVID-19 高效能運算聯盟: COVID-19 HPC Consortium
#buildforCOVID19 : COVID-19 Global Hackathon
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